1990年1月17日，冯文林任化学系党总支书记，孙兆祥被免去化学系党总支书记职务；3月，郭建权、金林培为化学系副系主任；5月11日，吴本佳任校党委青年部副部长，被免去化学系党总支副书记职务。

3月，刘若庄教授、傅孝愿教授等5人完成的“中间体、过渡态和反应途径势能面理论研究”获1990年国家自然科学三等奖。7月16—22日，第一次中日双边理论化学学术讨论会在我校和西北大学分别举行，参加者有诺贝尔奖获得者、日本的福井谦一教授，中科院学部委员，以及中日双方理论化学界的专家、学者30余人。12月7日，刘若庄教授等5人的“中间体、过渡态和反应途径势能面理论研究”获1990年国家科技奖励大会奖。

7月，经国家教育委员会研究，学校被评为1989年全国普通高等学校优秀教学成果奖励工作先进单位。10月17日，学校应用化学研究所成功研制的“从菜籽油制备芥酸”通过了由中国科学院、商业部和北京市部分高校专家组成的鉴定委员会的技术鉴定。12月11日，学校应用化学研究所承担的国家“七五”科技攻关项目“连续法合成环化聚异戊二烯抗蚀剂”通过专家鉴定。12月，化学系工化教研室研制的“计算机辅助教学软件”项目通过技术鉴定。本年度，余尚先研究员等完成的“液体感光树脂版系统与装置获1990年国务院重大技术、装备成果一等奖。