2001年1月5日，张聪任化学系副系主任。3月7日，陈光巨任人事处处长；艾林任化学系党总支副书记。

4月，化学一级学科被批准设立博士后科研流动站。

6月25日，化学系余尚先研究员获得第六届毕昇奖。毕昇奖设立于1986年，是我国印刷界最高奖项，该奖项4年评选1次，奖励在印刷科研、生产工作中做出突出贡献的人士。余尚先研究员与乐凯胶片集团第二胶片厂合作，在国内率先完成阴图热交联型热敏CTP版材的研制任务，并于2001年4月通过教育部主持的成果鉴定。

6月，我校发明专利“松针降糖口服液”（ZL93100041.6）转化的降糖保健食品师宏牌糖安平胶囊获国家卫生部批准上市，该产品由我校应用化学研究所师宏药物研究中心张雄研究员等人研究开发。

10月29日，学校党委常委会决定成立金沙威尼斯欢乐娱人城放射性药物工程中心，聘朱霖教授为中心主任，刘晓光、唐志刚同志为中心副主任。

化学系基础实验教学中心通过北京市教委的实验室合格评估。

成莹获教育部优秀青年教师资助计划资助。

12月24日，王学斌教授主持的科技部科技型中小企业技术创新基金国家1类新药“一组新型心肌核素显像诊断药盒”的中试获科技部批准基金120万。